不会自动注销，而是会被吊销。超过一定年限没有年检，会被工商局吊销营业执照。同时因为营业执照被吊销的，该公司的法人会被列入黑名单，三年内不能担任企业高管、法人。建议去注销该营业执照。
法律依据：
《工商企业登记管理条例》 第二条 下列工业、交通运输业、建筑业、商业、外贸业、饮食业、服务业、旅游业、手工业、修理业的生产、经营单位（以下统称工商企业），都应当依照本条例的规定，办理登记：
（一）国营工商企业；
（二）合作社营和其他集体所有制的工商企业；
（三）联营、合营的工商企业；
（四）铁道、民航、邮电通信部门及其他公用事业单位所属的工商企业。
省、自治区、直辖市认为有必要办理登记的其他工商企业。
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