公司与子公司的纳税不同是，由于分公司不具有法人资格，子公司具有法人资格，分公司的企业所得税要与总公司的汇总计算并缴纳，而子公司的企业所得税可以单独核算。
公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。”
“公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法承担民事责任。”
在主体法律地位上它们是完全不同的：
1、子公司在法律上是一个的法人，依法承担民事责任，即：以自己的名义进行各类民事经济活动;承担公司行为所带来的一切后果与责任。
2、分公司在法律上不是一个的法人，不具有承担民事责任的资格，也就是说它在法律上是从属于总公司的一个分支机构，不是的个体。
母公司与子公司之间一般表现的是股份的控制与被控制关系，也许是全资控制，也许是最大股东的控制。子公司在经济和决策上受母公司的支配与控制，但在法律上，子公司是的法人。
子公司拥有的名称和公司章程;具有的组织机构;拥有的财产。
子公司实行核算、自负盈亏。
分公司的办理：
1、向分公司所在地的公司登记机关申请登记；
2、向公司登记机关提交下列文件：
(一)公司法定代表人签署的设立分公司的登记申请书；
(二)公司章程以及加盖公司印章的《企业法人营业执照》复印件；
(三)营业场所使用证明；
(四)分公司负责人任职文件和身份证明；(五)国家工商行政管理总局规章要求提交的其他文件。分公司的公司登记机关准予登记的，发给《营业执照》。
法律依据：
《中华人民共和国企业所得税法》
第五十条除税收法律、行规另有规章外，居民企业以企业登记注册地为纳税地点登记注册地在境外的，以实际管理机构所在地为纳税地点。
居民企业在中国境内设立不具有法人资格的营业机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。
《中华人民共和国暂行条例》
第二十二条纳税地点：
固定业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在同一县(市)的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税财政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。
