同一控制下的股份有限公司的合并程序：初步确定合并方和被合并方公司；清算产权验资和财务审计；资产评估；确定产权低价；签订合并协议和转让价格管理。合并所需的资料是法定代表人签署的《企业变更（备案）登记申请书》；审批机关的批准文件；营业执照正副本等。
一、公司兼并应该遵从哪些程序
1、初步确定兼并方和被兼并方企业。
2、产核资和财务审计。
3、资产评估。
4、确定产权底价。
5、签署兼并协议和转让价款管理。
6、办理产权转让的清算手续和法律手续。
7、权利义务的承担和职工的安置。
二、办理新设合并需提交哪些资料
办理新设合并须提交资料：设立登记申请书；合并双方股东会决议；主管部门或者审批机关的批准文件；合并协议；合并双方各自的审计报告；企业主要负责人的身份证明；新设公司的验资报告；新设公司章程；场地使用证明；法律法规要求提交的其他文件。
三、股权转让登记的材料
办理股权转让变更登记所需材料有：
（1）法定代表人签署的《公司变更（备案）登记申请书》；
（2）企业申请登记委托书原件；
（3）经办人身份证明（复印件，核对原件）；由企业登记代理机构代理的，同时提交企业登记代理机构营业执照（复印件，须加盖本企业印章，并注明“与原件一致”）；
（4）根据公司章程的规定和程序提交的决议或决定（原件）；
（5）向原股东以外的人转让的，提交新股东的主体资格证明；
（6）公司章程修正案或新的公司章程（法定代表人签署）；
（7）股权转让协议；
（8）股东的资格证明复印件（核对原件）；
（9）企业法人营业执照正本、副本原件；
（10）法律、行规及决定规定变更股权必须报经审批的，提交有关部门的批准文件。
【本文关联的相关法律依据】
《公司法》第一百七十二条
公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
第一百七十三条
公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
