公司股权变更的，应按照下述标准缴纳变更费用：
1、营业税：
根据《财政部国家税务总局关于股权转让有关营业税问题的通知》对股权转让不征收营业税；
2、个人所得税：
根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的规定，原股东取得股权转让所得，应按“财产转让所得”项目征收个人所得税。
如股权转让方是个人，需要交纳个人所得税。
交纳标准：
按照转让成交价减去当初出资价和费用，按照此差额的20%交纳个人所得税；
3、印花税：
企业企业股权转让所立的书据，双方按照产权转移就股权转让书据计贴印花税。
适用税率为书据所载金额5‰。
比如以100万元的转让价款计算，个人所得税为20万元，印花税为5000元。
另外，公司股权变更需要提交材料有：
1、《公司变更登记申请表》；
2、公司章程修正案(全体股东签字、盖公章)；
3、股东会决议(全体股东签字、盖公章)；
4、公司执照正副本(原件)；
5、全体股东身份证复印件(原件核对)；
6、股权转让协议原件(注明股权由谁转让给谁，股权、债权债务一并转让，转让人与被转让人签字。
