父亲死了留下的土地使用证会被依法收回，个人只有土地使用权。
父亲去世，处理土地证的流程为：
1、去当地的派出所开具父亲的死亡证明；
2、去当地的土地资源管理部门办理更名手续，只要土地的使用权限没有到期，就能一直享有该土地的所有权。
不动产权证和土地使用证的区别：
1、性质不同：不动产证是房产证和土地使用权证书的合二为一；
2、防辐射标签：房产证没有防辐射标签，不动产证有防辐射标签；
3、内容不同： 房产证外页只有中华人民共和国房屋所有产权证，并无其它内容。房产证内页内容包括房屋所有权人、共有情况、房屋坐落、登记时间、房屋性质、规划用途、房屋状况和土地状况。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》 第十二条
土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行规执行。依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
第九条
城市市区的土地属于国家所有。农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有；宅基地和自留地、自留山，属于农民集体所有。
