如果雇主不批准员工的辞职申请，员工有以下几种选择：
1、员工可以继续履行原来的工作职责，直到雇主批准其辞职申请或者劳动合同期满。
2、员工可以与雇主协商解除劳动合同。在解除劳动合同时，双方应当根据具体情况协商约定解除劳动合同的条件和方式，如解除原因、解除时间、经济补偿等。如果双方无法协商一致，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请调解或者向劳动争议仲裁委员会提起劳动争议仲裁。
员工辞职的程序一般包括以下几个步骤：
1、提交书面辞职申请：员工应当书面向所在公司提交辞职申请，并注明辞职原因和离职时间等信息。如果是在劳动合同规定的试用期内辞职，应当提前告知公司，并注明试用期结束时间；
2、公司确认申请：公司需要确认员工的辞职申请，并进行审核。如有疑问或需要补充材料，可以要求员工进行补充或说明；
3、签署离职协议：如果公司同意员工的辞职申请，双方应当进行离职协议的签署。离职协议一般包括离职时间、工资结算、社保等方面的约定；
4、工资结算：公司需要对员工进行最后一次工资结算，并将工资、奖金、补偿等支付给员工。同时，公司还需要将员工的个人所得税代扣代缴；
5、办理社保手续：公司需要为员工办理社保等相关手续，如办理社保转移手续等；
6、离职手续完结：公司完成以上所有手续后，员工即可正式离职。
综上所述，在中国，员工提出辞职是其一项合法的权利，如果雇主不批准员工的辞职申请是基于违法或者不当的原因，员工可以向劳动监察机构投诉，要求雇主批准其辞职申请。
【法律依据】
《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条
用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。
第三十七条
劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。
