当事人持有与分公司的合同，且与其发生纠纷的，可以直接起诉总公司；分公司属于总公司的分支机构，其所作出的民事法律行为的后果均应当由总公司进行承担。
一、行政处罚会不会影响总公司
分公司行政处罚会影响总公司。分公司自身不具备法人资格，经工商登记并领取营业执照的分公司可以在工商核准的营业范围内对外从事经营活动。分公司作为总公司的分支机构，是总公司内部的一个组成部分，是总公司基于财税和经营便利等原因，根据总公司的意志所设立的对外从事总公司部分经营业务的机构，且分公司的经营范围不得超出总公司的经营范围。所以分公司行政处罚会影响总公司。
二、总公司债务分公司有义务承担吗
总公司债务不能由分公司承担。分公司只是总公司的分支机构，其不具有的法人资格，也没有的法人财产，它是不能承担民事责任的。也就是说分公司的债务尚且需要总公司来承担，所以对于总公司的债务分公司是不需要承担的，而且它也没有承担债务的法人资格。
三、分公司能经营吗
分公司是指一个公司管辖的分支机构，是公司在其住所以外设立的以自己的名义从事活动的机构。分公司可以从事生产经营活动，但是无法承担法律责任。分公司不具有企业法人资格，其民事责任由总公司承担。分公司属于分支机构，在法律上、经济上没有性，仅仅是总公司的附属机构。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国公司法》第十四条
公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
公司可以设立子公司，子公司具有法人资格，依法承担民事责任。
第十五条
公司可以向其他企业投资；但是，除法律另有规定外，不得成为对所投资企业的债务承担连带责任的出资人。
