烟叶属于农产品，如果烟叶是直接出售的话，那么它扣除率就是9%；但是烟叶用于继续加工生产成卷烟，那么卷烟未来对外出售税率是13%，则对应扣除率是10%。
收购烟叶可抵扣的一般按如下公式计算：
烟叶税=支付的价款总额×烟叶税税率（20%）。
支付的价款总额=收购价款×（1+固定价外补贴10%）。
收购烟叶准予抵扣的进项税额 =（收购烟叶实际支付的价款总额+烟叶税）×9%（或10%）。
烟叶税是以纳税人收购烟叶的收购金额为计税依据征收的一种税。2017年12月27日第十二届全国人民代表大会常务委员会第三十一次会议通过《中华人民共和国烟叶税法》，该法自2018年7月1日正式施行。在中华人民共和国境内收购烟叶的单位为烟叶税的纳税人。纳税人应当依照本条例规定缴纳烟叶税。条例所称烟叶，是指晾晒烟叶、烤烟叶。烟叶税的应纳税额按照纳税人收购烟叶的收购金额和规定的税率计算。烟叶税实行比例税率，税率为20%。烟叶税由地方税务机关征收。
基本原则是：
1、税制平稳过渡：烟叶税税制要素的确定基本上沿用原烟叶特产农业税的规定。
2、统筹兼顾：既要兼顾烟草行业和地方的利益，也要兼顾税法的规范化要求。
3、统一税政和公平税负：既要有利于公平税负、规范烟叶收购行为和维护烟叶收购秩序，同时也要有利于税收的统一，有利于国家的宏观。【法律依据】
《中华人民共和国烟草专卖法》
第四条 烟叶税的税率为百分之二十。
第五条 烟叶税的应纳税额按照纳税人收购烟叶实际支付的价款总额乘以税率计算。
第六条 烟叶税由税务机关依照本法和《中华人民共和国税收征收管理法》的有关规定征收管理。
